红河卫生职业学院临床医学系成立于2015年6月，目前拥有临床医学一个专业。临床医学专业2015年开始招生，主要招收应届高中毕业达到一专录取线学生。首届招生三个班共173人，其中面向全省定向委培学生60人。

临床医学系现有专职教师18人，其中副教授6人，双师型教师14人。临床医学系办学充分依托红河州第一人民医院、红河州第三人民医院两个助理全科医生规范化培训基地，积极开展院校合作，共同制定临床医学专业“3+2”一体化人才培养方案，依据职业岗位能力的需求，应用先进的办学理念及教学方法，理论联系实践，早临床、多临床、反复临床，为学生提供充分接触岗位实际的机会，培养学生实际工作能力。

临床医学专业培养目标是：培养适应社会主义市场经济和基层医疗单位需要，注重全面发展，面向云南少数民族地区社区及农村基层临床工作第一线，具有良好的职业道德，牢固掌握临床医学专业职业岗位(群)所需要的基础理论知识和专业技能，能从事内、外、妇、儿、五官科常见病、多发病诊治和急、危、重症的应急处理，具有预防、医疗、保健、康复、健康教育和计划生育技术为一体的基层卫生工作的能力，能够为社会主义新农村建设服务,“懂语言、下得去、留得住、用得好”的高素质应用型人才。